Estonian Air lopettaa Kajaanin reitin lyhyen lentämisen jälkeen. Yhtiö lopettaa Kajaanin reitin talvikauden alkaessa lokakuussa. Samanaikaisesti yhtiö lopettaa myös muita kausireittejään.
Estonia Air lopettaa huhtikuussa aloittamansa Kajaanin reitin lokakuussa 2012. Mahdollisesta jatkosta kesäkaudelle 2013 ei ole vielä päätetty.
Yhtiö lopettaa lokakuussa myös kausireittinsä Tbilisiin, Hannoveriin, Nizzaan ja Venetsiaan. Myös näiden reittien uudelleenavaaminen kesälle 2013 on mahdollista.
Estonian Air liikennöi Suomessa Helsinkiin 21 kertaa viikossa, Jyväskylään kuudesti viikossa ja Joensuuhun kuudesti viikossa.
